69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3988 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 344 aa  714    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  44.68 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  42.47 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  40.98 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  41.44 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  39.75 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  39.34 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  39.32 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  38.46 
 
 		 299 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  35.22 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  34.4 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  34.67 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  32.77 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  32.63 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  32.34 
 
 		 260 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  32.63 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  32.2 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  34.21 
 
 		 278 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  33.62 
 
 		 260 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  30.8 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  32.5 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  32.51 
 
 		 247 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  33.94 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  35.68 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  35.67 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  27.51 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  25.99 
 
 		 261 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  30.11 
 
 		 262 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  27.59 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  26.22 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 193 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  22.07 
 
 		 202 aa  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  26.55 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  28.91 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  29.09 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  26.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  27.4 
 
 		 216 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 210 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  25.64 
 
 		 193 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  25.66 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  26.16 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  25.66 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  28.03 
 
 		 196 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 208 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  25.86 
 
 		 198 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  27.04 
 
 		 200 aa  46.2  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  22.95 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  27.48 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  27.65 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  24.82 
 
 		 209 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  23.4 
 
 		 194 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  23.4 
 
 		 194 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  24.44 
 
 		 188 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  23.01 
 
 		 218 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  26.24 
 
 		 210 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  23.42 
 
 		 205 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 210 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 210 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 210 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>