45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0042 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  82.85 
 
 		 276 aa  477  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  60 
 
 		 274 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  63.84 
 
 		 278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  53.78 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  45.75 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  46.05 
 
 		 342 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  45.74 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  45.27 
 
 		 247 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  38.38 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  37.44 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  33.63 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  32.91 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  32.91 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  34.5 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  30.47 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  31.84 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  32.5 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  28.23 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  31.35 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  32.72 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  29.51 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  29.61 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  31.44 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  29.46 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  29.46 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  28.57 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  29.19 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  30.56 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  27.14 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  31.11 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  26.42 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  26.54 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  24.7 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.14 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  24 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  29.95 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  25.71 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  29.27 
 
 		 425 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  28.16 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  26.42 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 193 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>