32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5818 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  76.45 
 
 		 342 aa  344  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  52.5 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  50.79 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  33.47 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  32.28 
 
 		 299 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  28.96 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  28.23 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  25.94 
 
 		 344 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  30.33 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  28 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  28.38 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  33.93 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  27.54 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  27.75 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  31.28 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  28.72 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  28.72 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  27.43 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  26.99 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  30.35 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  25.68 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  33.17 
 
 		 276 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  32.02 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  32.2 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  26.2 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  24.02 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  33.78 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  25.22 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  24.79 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  36.09 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>