34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0829 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  35.24 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  36.93 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  37.87 
 
 		 283 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  34.89 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  34.89 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  34.89 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  33.63 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  32.34 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  33.06 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  32.02 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  37.88 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  38.8 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  37.37 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  31.96 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  32.74 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  35.35 
 
 		 342 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  31.19 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  33.01 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  30.73 
 
 		 415 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  33.95 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  27.91 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  31.44 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  27.83 
 
 		 342 aa  95.9  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  33.48 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  34.23 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  27.72 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  34.59 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  23.95 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  23.13 
 
 		 194 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  35.38 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>