50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2707 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  32.06 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 283 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  35.36 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  32.56 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  33.7 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  33.7 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  34.07 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  33.2 
 
 		 267 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.61 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  30.15 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.16 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  34.82 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  33.47 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  30.9 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  27.76 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  29.87 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  26.6 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  27.02 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  31.22 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  26.97 
 
 		 247 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  26.46 
 
 		 415 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  25.49 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  29.59 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  28.02 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  27.27 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  26.73 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  27.7 
 
 		 194 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  28.51 
 
 		 222 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 194 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 194 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.46 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  23.18 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 		 205 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  26.06 
 
 		 209 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  25.3 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  24.48 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  24.48 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  24.48 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  24.48 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  24.48 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  24.48 
 
 		 204 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>