76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0802 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  100 
 
 
291 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  94.85 
 
 
291 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  94.5 
 
 
291 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  72.39 
 
 
283 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 
280 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  40.98 
 
 
344 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  40.27 
 
 
279 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  39.26 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  31.48 
 
 
298 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  32.22 
 
 
274 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  35.86 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  33.63 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  34.88 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  34.73 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  34.89 
 
 
260 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  33.05 
 
 
415 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  33.2 
 
 
312 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  32.2 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.44 
 
 
276 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  36.44 
 
 
276 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  33.02 
 
 
342 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.02 
 
 
276 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  31.33 
 
 
247 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  34.4 
 
 
262 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  36.63 
 
 
303 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  29.75 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  30.57 
 
 
342 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  31.32 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  30.73 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  31.98 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  29.92 
 
 
197 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  26.49 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  27.64 
 
 
196 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  27.83 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  27.83 
 
 
218 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  24.65 
 
 
194 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  24.65 
 
 
194 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 
204 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  26.96 
 
 
218 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  23.57 
 
 
204 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 
187 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  27.33 
 
 
626 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 
203 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  24.65 
 
 
194 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  26.44 
 
 
222 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  26.62 
 
 
190 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  28.14 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  23.57 
 
 
209 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  27.31 
 
 
208 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 
207 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  22.67 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  24.84 
 
 
213 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  26.53 
 
 
202 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 
209 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 
199 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  28.76 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  23.31 
 
 
188 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  28.57 
 
 
198 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  26.52 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  26.58 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  23.33 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  27.18 
 
 
205 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 
199 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  27.74 
 
 
204 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>