247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3047 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
282 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  36.26 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  34.98 
 
 
291 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.23 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 
210 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 
211 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  31.41 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  29.34 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  25.73 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  32.19 
 
 
204 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  31.41 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  30.06 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.11 
 
 
626 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  28.79 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  26.19 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  25.62 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 
188 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  28.76 
 
 
241 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  30.67 
 
 
198 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  31.58 
 
 
444 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  32.37 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  28.36 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 
205 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  27.68 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  31.98 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  31.79 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 
187 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 
203 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  27.27 
 
 
195 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  27.33 
 
 
195 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 
203 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  27.33 
 
 
195 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 
219 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  25.82 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  27.33 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  27.33 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  27.95 
 
 
195 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  27.33 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  27.33 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  24.63 
 
 
342 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  26.71 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 
200 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  27.71 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  29.22 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  27.8 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  20.96 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  24.47 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  27.8 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  27.8 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  26.51 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  26.23 
 
 
196 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  28.09 
 
 
218 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  26.9 
 
 
203 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  26.28 
 
 
197 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 
215 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 
210 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  30.61 
 
 
193 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
201 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  30.26 
 
 
197 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 
205 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.92 
 
 
197 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 
205 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 
204 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 
231 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  26.35 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  25.9 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  26.06 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  28.4 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  26.14 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  26.14 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  26.14 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  26.14 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  29.66 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  26.14 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  26.14 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 
191 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  24.86 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  27.52 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  26.7 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  28.14 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  28.37 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  25.53 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  26.59 
 
 
228 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 
206 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  26.14 
 
 
197 aa  55.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1631  electron transport protein SCO1/SenC  28.9 
 
 
231 aa  55.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.255836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>