61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1822 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  100 
 
 		 313 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  55.88 
 
 		 415 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  61.94 
 
 		 247 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  54.98 
 
 		 342 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  43.08 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  46.56 
 
 		 274 aa  242  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  48.2 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  45.49 
 
 		 276 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  45.06 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  43.75 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  33.46 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  33.46 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  37.66 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  33.07 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  34.06 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  30.36 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  34.11 
 
 		 283 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  30.51 
 
 		 279 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  31.71 
 
 		 312 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  31.84 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  30.04 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  32.4 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  25.85 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  28.83 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  30.04 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  28.14 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  31.78 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  25.57 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  26.43 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  24.29 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  24.44 
 
 		 202 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  23.49 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  23.42 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  28.81 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  25.41 
 
 		 208 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0793  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 		 223 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  28.17 
 
 		 207 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  26.24 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  28.07 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  25.53 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  25.53 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  25.53 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  25.53 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  25.53 
 
 		 204 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  25.32 
 
 		 190 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  25.53 
 
 		 204 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  26.18 
 
 		 220 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  23.08 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  22.3 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  25.71 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  27.84 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  25.9 
 
 		 193 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 221 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  29.73 
 
 		 221 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 221 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>