40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2418 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  38.96 
 
 
283 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  37 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  41.67 
 
 
276 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  40.83 
 
 
276 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  41.25 
 
 
276 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  34.45 
 
 
291 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  34.58 
 
 
280 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  34.45 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  32.77 
 
 
291 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
279 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  37.04 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  33.06 
 
 
260 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  31 
 
 
415 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  33.91 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  33.66 
 
 
313 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  27.97 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  30.29 
 
 
247 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  30.62 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  29.54 
 
 
276 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  29.61 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  30.41 
 
 
342 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 
267 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  33.14 
 
 
303 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  31.3 
 
 
260 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  25.42 
 
 
342 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  30.32 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  24.55 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  25.21 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  28.68 
 
 
196 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  26.97 
 
 
222 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 
197 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  28.45 
 
 
198 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  22.41 
 
 
218 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  21.92 
 
 
209 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  20.55 
 
 
204 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>