46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0248 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  71.55 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  60.15 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  60 
 
 		 276 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  54.55 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  49.78 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  48.89 
 
 		 247 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  48.21 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  50.73 
 
 		 342 aa  232  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  42.92 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  36.32 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  33.04 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  31.76 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  31.76 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  34.93 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  32.02 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  34.41 
 
 		 299 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  32.77 
 
 		 344 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  33.91 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  31.69 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  32.84 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  32.84 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  32.21 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  27.71 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  32.34 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  29.23 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  26.64 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  28.05 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  26 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  26.52 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  20.96 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  28.08 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  33 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  29.05 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  31 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  31 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  24.56 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  27.13 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  28.07 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 425 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>