75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1542 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  100 
 
 		 342 aa  701    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  46.04 
 
 		 415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  57.33 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  45.04 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  49.33 
 
 		 247 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  48.23 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  44.94 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  44.94 
 
 		 276 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  43.97 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  37.05 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  36.68 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  32.08 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  30.42 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  30.42 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  33.62 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  29.92 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  30.45 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  27.93 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  29.51 
 
 		 312 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 		 267 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  24.89 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  27.78 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  26.52 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  25.65 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  25.22 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  24.72 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  26.2 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  24.51 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  22.52 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  24.53 
 
 		 202 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  23.13 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  29.57 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  27.8 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  25.34 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  25.25 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  27.14 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  27.14 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  27.08 
 
 		 193 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  23.31 
 
 		 197 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  24.71 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  26.43 
 
 		 204 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  29.92 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  26.43 
 
 		 204 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  26.43 
 
 		 204 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  26.43 
 
 		 204 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  25.71 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  26.43 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  24.48 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  25.75 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 210 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  21.08 
 
 		 228 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  23.7 
 
 		 196 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  23.89 
 
 		 193 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  34.07 
 
 		 206 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  28.57 
 
 		 243 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1728  hypothetical protein  27.97 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  25.83 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0793  electron transport protein SCO1/SenC  23.48 
 
 		 223 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  21.23 
 
 		 194 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 210 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 210 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 211 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 210 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>