41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4181 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  54.51 
 
 		 342 aa  234  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  55.72 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  50.2 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  33.76 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  33.76 
 
 		 291 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  34.18 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  30.04 
 
 		 280 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  31.84 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  29.88 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  34.65 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  34.23 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  27.31 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  31.76 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  31.75 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  29.44 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  29.91 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  31.86 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  31.86 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  30.9 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  31.86 
 
 		 276 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  28.04 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  28.97 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  31.3 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  28.95 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  24.88 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  28.8 
 
 		 415 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  29.75 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  23.94 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  26.77 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  38.03 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  30.51 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  30.51 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  30.51 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  30.51 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  30.51 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  31.36 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  23.08 
 
 		 205 aa  42.4  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  29.6 
 
 		 209 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 221 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>