255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2200 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  464  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  42.49 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  35.98 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  33.8 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  30.81 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  33.73 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  31.05 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 188 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  29.67 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  32.16 
 
 		 190 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  31.68 
 
 		 444 aa  88.6  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  30.49 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  30.43 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  29.27 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  29.27 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  29.81 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.81 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  29.81 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  29.81 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.27 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  29.81 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  32.21 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  27.71 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  28.86 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  32.48 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  35.16 
 
 		 356 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  25.29 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  30.47 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  26.04 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  35.05 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  27.85 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 363 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  26.04 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  31.51 
 
 		 327 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  31.51 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  35.04 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  25.42 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  33.02 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  31.91 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  25.42 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  25.42 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  24.69 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  23.97 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  38.03 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  38.03 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  27.82 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  22.51 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  28.68 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  27.81 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  24.43 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  24.22 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  24.55 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  23.26 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2964  electron transport protein SCO1/SenC  28.39 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  24.12 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  21.92 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  35.21 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  27.56 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  23.3 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  23.3 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  23.3 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  24.32 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  25.38 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  25.19 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  23.3 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  26.39 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  25.69 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  25.69 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  25.69 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  25.69 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  25.69 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  23.08 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  26.78 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  30.6 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  27.42 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  27.69 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  25.69 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  23.95 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>