297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2077 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  30.23 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  31.13 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  32.81 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  33.74 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  34.38 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  36.55 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  35.66 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  31.58 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  29.65 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  30.59 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  30.82 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  33.99 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  26.74 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  28.86 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  32.77 
 
 		 197 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  30.08 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1503  hypothetical protein  29.41 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.522768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  28.22 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.74 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  31.47 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3710  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  30.19 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  30.66 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2165  transmembrane protein  28.4 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0585637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  28.47 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  30.5 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  30.2 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  26.28 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  26.28 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  26.28 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  26.28 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  26.28 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  28.47 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  26.28 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  32.85 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  30.38 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  28.07 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  34.81 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  26.28 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  30.56 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  30.54 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  26.45 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  28.06 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  27.46 
 
 		 200 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  28.78 
 
 		 197 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  36.7 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  28.06 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>