More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3791 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 217 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  49.1 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  51.23 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  39.8 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  37.01 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  33.18 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 425 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  32.51 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  29.33 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  29.33 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  27.85 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  31.93 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  31.93 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  31.93 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  31.09 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  31.09 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  31.09 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  31.09 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  31.09 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.3 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  35.9 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  38.14 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.3 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  37.96 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  28.32 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  25.86 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  25.95 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  30.12 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  29.86 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  28 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  27.44 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  30.09 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  29.87 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  28.83 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  29.03 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  28.8 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  29.01 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  34.94 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  32.32 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  36.9 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  28.46 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  29 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  29.52 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  29.52 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  29.52 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  29.52 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  29.52 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  29.52 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  29 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  21.95 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  28.46 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  24.52 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  33.02 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  30.66 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.04 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  24.03 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  22.86 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  25.16 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  27.5 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  29.91 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>