292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1663 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  47.89 
 
 
243 aa  195  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  43.02 
 
 
210 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  41.42 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  37.57 
 
 
213 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 
217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  37.63 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  37.71 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 
236 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 
240 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 
210 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  33.73 
 
 
223 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  32.93 
 
 
221 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  39.13 
 
 
444 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  27.75 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  34.71 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  32.53 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 
248 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 
291 aa  78.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  29.8 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  29.76 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  29.76 
 
 
195 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  29.94 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  30.36 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  30.36 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30.36 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30.36 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  30.36 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  30.36 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  32.59 
 
 
211 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  31.11 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  28.92 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  26 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  26 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  26 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  25.17 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  25.88 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  31.51 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  25.17 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  34.26 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  26.03 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  25.68 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  24.49 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  24.49 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  25.55 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  25.55 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  25.55 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  25.55 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  36.84 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  27.74 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  31.88 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
196 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 
197 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  26.79 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  26.29 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  30.37 
 
 
210 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
198 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  34.74 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  31.54 
 
 
186 aa  60.1  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  34.74 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  27.74 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  30.56 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 
356 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 
199 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  24.85 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  31.53 
 
 
193 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  24.11 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  31.53 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  36.46 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  25.61 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  25.49 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  30.08 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  32.79 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  28.99 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  22.08 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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