199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2495 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 213 aa  447  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  54.41 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  46.43 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  44 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  46.41 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  39.52 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  40.7 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  37.43 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  37.57 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  35.47 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  37.89 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  31.51 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  31.21 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  28.92 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  30.57 
 
 		 444 aa  78.2  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  29.41 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  29.3 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  29.41 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.41 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  29.41 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  28.48 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  29.49 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  29.41 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.85 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  28.66 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  28.22 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  26.34 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  25.36 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  33.98 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  35.92 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  30.15 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  29.8 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  27.4 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  24.16 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  27.4 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  27.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  29.79 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  29.79 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  29.79 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  29.79 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  29.79 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  29.79 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  25.24 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  26.19 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  29.29 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 275 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  27.94 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  26.32 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  26.32 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  26.88 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  26.32 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  26.32 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  26.32 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  32.84 
 
 		 706 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  34.91 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  22.43 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  36.27 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  27.34 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  26.32 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  26.32 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  26.42 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  22.29 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>