161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2512 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  54.41 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  46.63 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  48.21 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  46.63 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  43.69 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  39.15 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  37.86 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 		 240 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  31.9 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.71 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  31.21 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  31.09 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  30.97 
 
 		 444 aa  92.8  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  28.16 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  27.67 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  27.5 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  26.71 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  26.88 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  27.67 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  27.67 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  27.67 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  27.67 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  27.04 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  26.42 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  28.79 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  35 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  29.24 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  29.24 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  28.04 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  25.69 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  27.98 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  25.88 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  29.08 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 363 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  23.6 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  29.08 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  26.99 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  22.49 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  26.53 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  24.66 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  26.36 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  26.52 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  26.26 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  27.97 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  21.25 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  26.32 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  26.62 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  26.62 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  27.36 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  26 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  25.14 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  29.81 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  24.82 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  26.04 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  27.12 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  26.02 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  25.9 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  29.09 
 
 		 425 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  23.35 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  27.03 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  26.88 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  31.75 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  24.06 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  24.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  24.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  24.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  24.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  30.1 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  27.22 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  23.31 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>