233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0960 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  60.63 
 
 		 223 aa  266  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  51.23 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  37.44 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  39.9 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  44.57 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  39.52 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  38.54 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  42.94 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  36.24 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  36.52 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  35.05 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  30.36 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  32.93 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  35.15 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.06 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 195 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  33.76 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  33.76 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  33.76 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  34.39 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  33.76 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  33.76 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  30.21 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  34.21 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  34.21 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  34.21 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  28.93 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  23.45 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  25.86 
 
 		 250 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.03 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  29.22 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  28.71 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  26.73 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  26.73 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  26.45 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  28.17 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  34.29 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  23.21 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  23.74 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  25.12 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  29.8 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  23.5 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  24.63 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  27.39 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  25.98 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  27.74 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  32.84 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  27.74 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  27.74 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  27.74 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  24.59 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  27.52 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  29.55 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  27.74 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  27.01 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  26.54 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  24.53 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  27.01 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  22.54 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  27.01 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  26.9 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  30.69 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  26.9 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 327 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 327 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  26.42 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  24.59 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  28.1 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  26.4 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  24.12 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  26.85 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  27.01 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  26.81 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  29.13 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  26.81 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  27.86 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  26.28 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>