129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5146 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 228 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  42.13 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  37.44 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  42.94 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  45.06 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  38.99 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  39.51 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  40.37 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 220 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  39.24 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  31.51 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  34.64 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.09 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  29.24 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  30.19 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  29.81 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  30.19 
 
 		 195 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  27.81 
 
 		 444 aa  71.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  29.38 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  29.38 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  29.56 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.56 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.56 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  29.56 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  29.56 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  32.72 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  28.4 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  28.76 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0482  hypothetical protein  27.37 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  27.4 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  25.17 
 
 		 626 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  31.43 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  28.4 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  31.43 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  31.43 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  31.43 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  29.88 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  31.43 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  29.34 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  31.43 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  31.43 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  24.84 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  24.54 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  24.24 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  25.68 
 
 		 204 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  31.52 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  27.1 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  30.7 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  32.18 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.83 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  26.71 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  24.71 
 
 		 342 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  23.04 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  36.78 
 
 		 327 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  23.9 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  29.22 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3059  electron transport protein SCO1/SenC  28.45 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  32.5 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  23.61 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  25.5 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  28.18 
 
 		 218 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  32.58 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  29.45 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  29.45 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  29.19 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  26.37 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  29.45 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  29.45 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  29.45 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  29.45 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  29.45 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  22.92 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  29.19 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  28.4 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  27.97 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  23.53 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>