270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5677 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
236 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  42.49 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  42.46 
 
 
220 aa  158  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  44.57 
 
 
221 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  39.09 
 
 
223 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  40.7 
 
 
213 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 
210 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  42.62 
 
 
223 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  36.2 
 
 
228 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 
210 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.87 
 
 
217 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  38.99 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  36.56 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 
213 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 
228 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  34.36 
 
 
243 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  29.87 
 
 
444 aa  95.9  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 
188 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  29.7 
 
 
194 aa  89  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 
190 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  29.09 
 
 
195 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  29.63 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  30.67 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 
363 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  29.63 
 
 
195 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.63 
 
 
195 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  29.7 
 
 
195 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  29.63 
 
 
195 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  29.63 
 
 
195 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.01 
 
 
195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  37.19 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3464  hypothetical protein  25.89 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0184964 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  38.39 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  30.26 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  35.45 
 
 
425 aa  71.6  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  35.78 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  39.09 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  26.25 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  33.79 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  30.19 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  28.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  36.54 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  31.88 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  30.61 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  34.58 
 
 
356 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  26.67 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  29.17 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  30.61 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
197 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  32.38 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  25.66 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  32.73 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  31.29 
 
 
210 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  33.05 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  26.74 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  35.11 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  27.88 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  30.49 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 
197 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 
211 aa  58.9  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.17 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  34.34 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  32.67 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  27.38 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  24.5 
 
 
196 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  28.05 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  25.53 
 
 
282 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  36.14 
 
 
196 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
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