229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03980 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  60.63 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  42.13 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  40.53 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  41.3 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  42.62 
 
 		 236 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  35.47 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  41.82 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 213 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  35 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  34.71 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.27 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  34.36 
 
 		 190 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  30.81 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  34.15 
 
 		 195 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  34.15 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  34.15 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  34.15 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  34.15 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  34.15 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  33.54 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  33.54 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  28.31 
 
 		 444 aa  82.4  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  32.93 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  30.82 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  22.62 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.2 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  27.93 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  25.14 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  30.3 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  28.38 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  34.58 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  30.1 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  27.74 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  29.29 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  30.63 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  27.95 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  32.08 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  32.08 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  31 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  23.57 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  25.15 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  26.16 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  25.15 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  27.78 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  27.1 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  29 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  29.32 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  23.49 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  26.77 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  27.33 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  28.81 
 
 		 425 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  25.64 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  21.6 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  26.52 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  25.37 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  29.59 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  25.37 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  23.35 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  25.37 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  22.29 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  25.15 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  22.22 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0851  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.46 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  24.48 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  26.06 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>