63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0301 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  33.68 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  31.05 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  31.09 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  30.21 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  26.94 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  28.92 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  30.81 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  29.24 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  34.51 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  26.95 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  34.23 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.06 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  31.48 
 
 		 425 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  34.26 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  23.58 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  23.85 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3464  hypothetical protein  24.31 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0184964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  29.36 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  24.32 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.2 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  34.41 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.29 
 
 		 626 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  34.41 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  34.41 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.35 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  23.57 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  23.57 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  23.27 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  31.37 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  24.65 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  24.65 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  24.65 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  24.65 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  24.55 
 
 		 291 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  24.65 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  26.85 
 
 		 363 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  20.54 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  23.57 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  30.61 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  27.82 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  25.24 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  26.32 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  20.14 
 
 		 205 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>