275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0931 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  75.6 
 
 		 250 aa  357  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  47 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  33.85 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  32.52 
 
 		 444 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  31.31 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  28.07 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  30.26 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  31.02 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  23.45 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  33.88 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  29.73 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  33.64 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  29.08 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  33.93 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  25.62 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  26.61 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  25.68 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  34.82 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  34.91 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  32.19 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  28.4 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  22.17 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  25.81 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  33.15 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  31.51 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  27.47 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  30.92 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  29.81 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  25.16 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  25.16 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  26.25 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.23 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  25.16 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.16 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.16 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  25.16 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  25.16 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2847  electron transport protein SCO1/SenC  34.92 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  25.16 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  28.04 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  26.38 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  25.81 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  29.06 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  27.94 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  34.66 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  29.19 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  32.23 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  28.23 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3196  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  29.52 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  35.19 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>