85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02320 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  73.13 
 
 		 227 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  40.56 
 
 		 182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  39.18 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  38.5 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  39.66 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 217 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  29.51 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30.58 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  29.75 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  29.75 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  30.58 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.75 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  29.75 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  29.75 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  26.04 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  28.93 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  26.49 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  37.76 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  30.08 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  26.36 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  25.76 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0482  hypothetical protein  34.91 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  26.92 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  26.4 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  24.82 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 		 425 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  22.86 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.67 
 
 		 626 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  26.02 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  32.91 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  25.53 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3059  electron transport protein SCO1/SenC  27.86 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  34.18 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  27.1 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.77 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  25 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  23.39 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  22.31 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  26.34 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0318  hypothetical protein  27.84 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.176028  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  26.37 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  25.3 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  26.37 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  25.56 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  24.37 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  24.37 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  26.26 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  24.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  29.66 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  25.98 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  24.71 
 
 		 219 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  37.29 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  26.37 
 
 		 221 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  29.57 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>