35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0318 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0318  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  294  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.176028  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 
282 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 
240 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
283 aa  48.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 
197 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  27.48 
 
 
236 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  26.73 
 
 
291 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  32.89 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  27.36 
 
 
196 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
296 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  27.55 
 
 
227 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 
425 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 
208 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  26.83 
 
 
356 aa  42.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  30.86 
 
 
363 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  23.53 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  24.59 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  23.53 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  23.53 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  23.53 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  23.53 
 
 
195 aa  42  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 
327 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 
195 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 
327 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 
327 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  22.69 
 
 
195 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  22.69 
 
 
195 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 
194 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  26 
 
 
217 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  22.69 
 
 
195 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  22.69 
 
 
195 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  26.79 
 
 
200 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>