110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1264 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  55.81 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  39.07 
 
 		 204 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  38.28 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  42.39 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  38.1 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  36.87 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  36.27 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  37.95 
 
 		 182 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  27.45 
 
 		 626 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.66 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  26.32 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  25.76 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  26.36 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  24.81 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  28.37 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  23.6 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  25 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  25 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  27.88 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  25 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  25 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  25 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  25 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  35.23 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  36.36 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.24 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  28.38 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  34.91 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  26.99 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  27.94 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  26.87 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  29.55 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  30.23 
 
 		 425 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  23.62 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  36.71 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  36.71 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  36.71 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  36.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  36.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  36.71 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  25.79 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  27.67 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  35.19 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  29.17 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  24.12 
 
 		 444 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  23.91 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  26.83 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  29.14 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  29.14 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  29.14 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2964  electron transport protein SCO1/SenC  27.49 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0318  hypothetical protein  32.89 
 
 		 139 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.176028  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  30.33 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  26.72 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 363 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  26.72 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  26.72 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  26.72 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  26.72 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  26.72 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  26.72 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  29.46 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  37.08 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  25.75 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  31.2 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  24.41 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  25.16 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  29.46 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  29.13 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  29.13 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  28.68 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  28.68 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  28.68 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  28.68 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  28.68 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  23.7 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  26.15 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  27.34 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>