84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1756 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  99.49 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  98.92 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  98.92 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  98.39 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  98.92 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  43.71 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  43.71 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  43.71 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  43.05 
 
 		 200 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  43.05 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  43.05 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  43.05 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  43.05 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  42.95 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 327 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  35.54 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  35.54 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  29.29 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  35.05 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  32.58 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  30.3 
 
 		 235 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  27.92 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 291 aa  51.6  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  33.71 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  28.57 
 
 		 444 aa  49.3  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  33.88 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  32.58 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  36.71 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  32.58 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  22.54 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  32.58 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  26.87 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  25.98 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  26.27 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  25.74 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  31.13 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  33.8 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.73 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.82 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  27.08 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  27.08 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  28.33 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  25.7 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  28.33 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.02 
 
 		 626 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  22.96 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0300  redoxin domain-containing protein  29.67 
 
 		 286 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0327  electron transport protein SCO1/SenC  29.31 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3697  electron transport protein SCO1/SenC  29.31 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 211 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 211 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  29.27 
 
 		 210 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  30.85 
 
 		 194 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 211 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  30.85 
 
 		 194 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  36.62 
 
 		 240 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  32 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  27.54 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  28.36 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  24.41 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>