62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4325 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  40.56 
 
 		 227 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  41.42 
 
 		 227 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  37.95 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  34.39 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  27.5 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  30.97 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  24.85 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.24 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  30.91 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 425 aa  55.1  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  23.48 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  24.09 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.31 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  22.73 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  28.18 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  24.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  24.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  24.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  24.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  24.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  24.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  24.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  25.66 
 
 		 247 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 		 240 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  23.45 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  31.46 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  24.43 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  31.33 
 
 		 444 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 198 aa  45.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  22.76 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 363 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  26.02 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  23.87 
 
 		 327 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  25.66 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  23.87 
 
 		 327 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  23.87 
 
 		 327 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  26.6 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  26.6 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  24.79 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  23 
 
 		 236 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  23.74 
 
 		 228 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  23.97 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>