244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1225 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  72.68 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  40.85 
 
 		 626 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  31.02 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  30.3 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  30.3 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  30.3 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  30.3 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  30.3 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  30.3 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30.3 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30.3 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  32.08 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  30.3 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  29.55 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.48 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  35.4 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  31.36 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  29.38 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  29.56 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  28.47 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  29.44 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  30.83 
 
 		 204 aa  62  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  26.74 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  36.28 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  27.34 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  28.49 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  28.49 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  28.92 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  28.68 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  28.49 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  28.49 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  28.49 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  28.49 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  26.06 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  30.24 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  28.49 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  29.24 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  28.97 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  25.49 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  29.46 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  21.97 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  36.17 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  21.97 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  28.29 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  27.63 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  27.72 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  27.63 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  25.81 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  28.19 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  27.45 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  24.68 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  29.7 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.13 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  28.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  24.83 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  28.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  28.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  25.5 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  28.38 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  26.43 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  28.49 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
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NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  25.74 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  22.5 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  27.85 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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