154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0188 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  39.57 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  42.51 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  38.74 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  32.64 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  36.27 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  32.07 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  29.38 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0793  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  36.04 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  26.17 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  26.39 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  26.9 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  32.19 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3059  electron transport protein SCO1/SenC  37.25 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  24.69 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  28.97 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  30.82 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  29.46 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  39.53 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  39.36 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  26.45 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  33.83 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  33.83 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  33.83 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  33.83 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  28.37 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  33.83 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  33.83 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.41 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  29.46 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  29.46 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  22.22 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  22.22 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  21.48 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 327 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  20.71 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  21.48 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  21.48 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  21.48 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  21.48 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  20.74 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  22.73 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  21.48 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  26.67 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  25.27 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  22.34 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  32.08 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1728  hypothetical protein  30.34 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  21.35 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  33.63 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2964  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  26.76 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  24.65 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  26.01 
 
 		 363 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  32.67 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  30.15 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  26.28 
 
 		 425 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  24.06 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.25 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  23.08 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  24.4 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  25.87 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>