29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1728 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1728  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  470  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0793  electron transport protein SCO1/SenC  47.75 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1631  electron transport protein SCO1/SenC  39.15 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3710  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2964  electron transport protein SCO1/SenC  39.44 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390521  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5225  Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems- like protein  38.12 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3059  electron transport protein SCO1/SenC  30.68 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  30.72 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  28.33 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  29.33 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  27.88 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.83 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4289  hypothetical protein  30.69 
 
 		 138 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0379422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  26.11 
 
 		 444 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  24.54 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  31.63 
 
 		 205 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  22.4 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  25.61 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  27.62 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0482  hypothetical protein  30.97 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  34.21 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  27.97 
 
 		 342 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  23.68 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  24.83 
 
 		 228 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>