124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0793 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0793  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
223 aa  455  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1728  hypothetical protein  47.75 
 
 
237 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00827926  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1631  electron transport protein SCO1/SenC  38.2 
 
 
231 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3710  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 
235 aa  142  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2964  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 
232 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390521  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5225  Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems- like protein  31.84 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3059  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
292 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  27.43 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  27 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  30.13 
 
 
283 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  27.66 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  23.43 
 
 
282 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  26.06 
 
 
208 aa  55.5  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  27.54 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 
248 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  25.62 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  29.25 
 
 
298 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
191 aa  52.4  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  27.33 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  26.02 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  24.37 
 
 
188 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  24.09 
 
 
197 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  26.99 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  24.47 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4289  hypothetical protein  37.11 
 
 
138 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0379422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  26.22 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  23.42 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
181 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 
181 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  26.09 
 
 
313 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  31.25 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  23.66 
 
 
444 aa  48.5  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  27.86 
 
 
209 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 
196 aa  48.5  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  26.06 
 
 
181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  24.2 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.82 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  25.79 
 
 
415 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  25.51 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  26.32 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 
210 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  27.38 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  21.17 
 
 
195 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 
231 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  28.33 
 
 
204 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 
218 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 
218 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  23.93 
 
 
201 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  29.14 
 
 
363 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  24.48 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 
217 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 
217 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  26.67 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  24.82 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002791  thiol peroxidase Bcp-type  24.71 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  23.81 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  28.38 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  27.33 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  21.86 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  22.52 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2235  electron transport protein SCO1/SenC  31.09 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  22.52 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  22.52 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  22.52 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  22.52 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  22.52 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  29.9 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  26.02 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.29 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  23.03 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  27.08 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  25.44 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  27.38 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  20.91 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  20.91 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  20.91 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  27.38 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  20.91 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>