More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01150 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  48.51 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  45 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  37.63 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  43.26 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  37.28 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  31.67 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  31.8 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  35 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  27.31 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  32 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  32.59 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  26.88 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  34.81 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  34.18 
 
 		 195 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 194 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  34.18 
 
 		 195 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 195 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  33.33 
 
 		 195 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  34.18 
 
 		 195 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  34.18 
 
 		 195 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  34.18 
 
 		 195 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  34.18 
 
 		 195 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  34.18 
 
 		 195 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 		 188 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  33.08 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  31.3 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  34.51 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  29.33 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  29.77 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  29.85 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  29.85 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  32.21 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  31.09 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  27.89 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  30.17 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  43.01 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  28.86 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  29.01 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  36.75 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  30.56 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  29.08 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  28.86 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  27.82 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  36.75 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  36.75 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  27.66 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  25.37 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  30.88 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.66 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  27.07 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  28.38 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  32.99 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  30.93 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  27.27 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  27.61 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  29.32 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  29.29 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  28.37 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  29.66 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  27.94 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  20.81 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  29.45 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  27.41 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 218 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  34.41 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
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NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
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NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
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NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  28.37 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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