134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0482 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  32.99 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  32.29 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  38.3 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  30.37 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  27.37 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  38 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  30.56 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  33.96 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  38 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  37 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  26.22 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  38 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  38 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  38 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  26.17 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  34.91 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  26.28 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  37 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  28.19 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  27.47 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  26.98 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  36 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  33.64 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  29.01 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  25.69 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  27.88 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  30.38 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  30.38 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  30.61 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  41.67 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0851  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.31 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  26.98 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  28.66 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  36.99 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.11 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  26.19 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  30.47 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  25.83 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  25.71 
 
 		 444 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  32.11 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  31.71 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1728  hypothetical protein  32.67 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  27.16 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1690  hypothetical protein  35.14 
 
 		 586 aa  45.1  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  31.94 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  22.73 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  31.5 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  32.58 
 
 		 626 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  37.5 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  31.94 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  28.68 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  21.62 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  29.36 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  23.78 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>