20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1690 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1690  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1143    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0263  hypothetical protein  33.72 
 
 		 422 aa  150  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0241584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0851  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.38 
 
 		 206 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 221 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 221 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 208 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 221 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  31.52 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.98 
 
 		 210 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  26.03 
 
 		 190 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1740  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  36.05 
 
 		 155 aa  48.5  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 291 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  25.75 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  29.03 
 
 		 526 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  24.76 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 		 222 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  31.48 
 
 		 205 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  28.65 
 
 		 223 aa  44.3  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  27.87 
 
 		 188 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0482  hypothetical protein  36.11 
 
 		 223 aa  44.3  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>