More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03040 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  79.38 
 
 
194 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  79.38 
 
 
194 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  67.7 
 
 
204 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  67.7 
 
 
204 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  67.08 
 
 
204 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  67.08 
 
 
204 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  67.08 
 
 
204 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  67.08 
 
 
204 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  67.08 
 
 
209 aa  227  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  66.46 
 
 
204 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  40.41 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  25.75 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  27.22 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.18 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  26.23 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 
231 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
221 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  29.59 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  30 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  27.34 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  29.59 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  26.11 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  27.11 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  30.16 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  29.11 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  30.83 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  28.83 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  25.9 
 
 
299 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  25.71 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.76 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  28.22 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 
221 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 
283 aa  62  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  28.22 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  28.83 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  33.65 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  30.65 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  28.08 
 
 
205 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 
219 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  30.83 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  29.35 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  26.62 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  30.83 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  36.14 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  30.83 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  30.83 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  30.83 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  29.09 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  30.83 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  25.95 
 
 
276 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  27.97 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
181 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  25.95 
 
 
276 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
181 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  36.14 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  26.9 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  27.97 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  28.4 
 
 
199 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  36.14 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  36.14 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  36.14 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  32.87 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  30.3 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  29.08 
 
 
217 aa  58.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  28.87 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  25.95 
 
 
276 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  30.92 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  27.94 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 
197 aa  58.2  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  31.79 
 
 
220 aa  58.2  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  34.35 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  28.29 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  33.98 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
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NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
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