150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0714 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  93.57 
 
 
200 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  43.39 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  43.39 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  43.58 
 
 
186 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  43.02 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  43.02 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  43.02 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  46.58 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 
222 aa  87.8  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 
327 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 
327 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 
327 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  35.59 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.83 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  32.81 
 
 
340 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 
425 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  33.9 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  36.97 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  25.85 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  30.51 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  38.46 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 
271 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  29.33 
 
 
194 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  30.11 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 
217 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  30.11 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  25.69 
 
 
356 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  26.52 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  33.65 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  36.28 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  26.52 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  25.48 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  36.84 
 
 
626 aa  55.1  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 
205 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  26.05 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  26.05 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  26.05 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  26.05 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  26.05 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  26.05 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  26.05 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  26.05 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  25.93 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  26.38 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  27.88 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  25.21 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  27.55 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  29.52 
 
 
310 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  26.45 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 
206 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  22.99 
 
 
236 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  31.46 
 
 
198 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 
199 aa  51.6  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  42.65 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  23.81 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  32.29 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  33 
 
 
275 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  30.16 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  26.59 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  28.49 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  23.61 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  23.49 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  31.25 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.49 
 
 
283 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  28.44 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  27.62 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  24.14 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  27.83 
 
 
246 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  31 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.37 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  30.21 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  30.15 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  24.11 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  30.21 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  30.21 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  30.21 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  30.21 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  30.21 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>