More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3067 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 216 aa  436  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  50.9 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  46.59 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  45.22 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  45.86 
 
 		 296 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  39.09 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  37.44 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  47.33 
 
 		 310 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  38.33 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  42.21 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.3 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  38.96 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.71 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  46.96 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  46.96 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  35.47 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  34.8 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  33.04 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  32.87 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  33.18 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  33.18 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  32.27 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  41.96 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  44.74 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  40.3 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  40.3 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.42 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  38.57 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  40.3 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  43.52 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  45.05 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  40.3 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  38.57 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.57 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.57 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  38.57 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  39.29 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  38.57 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  38.57 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  38.57 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  32.39 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  36.99 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.71 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  37.41 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.71 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  36.11 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0405  electron transport protein SCO1/SenC  39.82 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  42.5 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  32.62 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.71 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  34.81 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 196 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  42.5 
 
 		 197 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  32.94 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  36.69 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>