288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1277 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  43.35 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  38.53 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  43.9 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  38.07 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  38.15 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  40.12 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  40.74 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  32.94 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  42.98 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0405  electron transport protein SCO1/SenC  41.74 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  46.6 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  45.87 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  38.61 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  41.04 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
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NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.03 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  39.5 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  41.04 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  36.43 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  41.04 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  42.06 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  41.32 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  31.1 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  35.92 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  43.14 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  34.85 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  47.44 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  43.56 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  37.29 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  42.55 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  43.62 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  39.64 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  46.15 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  38.98 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  32.2 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  34.4 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.67 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  36.49 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  47.92 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  41.49 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  40.32 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  45.79 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  46.15 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  39.37 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  37.61 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  43.18 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.35 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  36.44 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  47.62 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  47.56 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  47.62 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  44.05 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  47.56 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
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NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  44.05 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  32.52 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  44.05 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
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NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  40.59 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
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NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
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