281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0405 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0405  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  43.24 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  44.04 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  43.14 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  44.23 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.96 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  35 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  32.32 
 
 		 198 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  43.69 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  35.25 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  28.81 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  30.41 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  38.28 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  34.43 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  38.35 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  41.74 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 		 199 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  43.68 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
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NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  39.39 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  45.88 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  37.67 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  39 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  43.68 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  29.34 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  41.05 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
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NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  38 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
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NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
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NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  45.88 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  39 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  36.21 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  39.23 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  39.23 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  39.23 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  39.23 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  27.71 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  39.23 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  27.71 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  40.62 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  38.83 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  38.83 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  38.83 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  38.83 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  38.83 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  34.23 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  38.83 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  34.11 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  39.6 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  44.32 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  33.11 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.73 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.05 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  30.56 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
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NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.06 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  41.28 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  41.75 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  34.23 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  41.28 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  35.05 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  32.43 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  37.37 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
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