84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0648 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  99.46 
 
 
186 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  99.46 
 
 
197 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  98.92 
 
 
197 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  43.71 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  43.71 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  43.71 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  43.05 
 
 
200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  43.05 
 
 
204 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  43.05 
 
 
204 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  43.05 
 
 
204 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  43.05 
 
 
204 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  42.95 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 
425 aa  78.6  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 
327 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  35.54 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  35.54 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  31.41 
 
 
340 aa  71.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  29.29 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  29.69 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 
363 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  31 
 
 
356 aa  57.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  34.74 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  32.58 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  34.25 
 
 
216 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  30.3 
 
 
235 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  26.62 
 
 
222 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 
291 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  29.46 
 
 
444 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  33.04 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  33.88 
 
 
208 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 
232 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  36.71 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 
232 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 
232 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 
232 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 
219 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  27.61 
 
 
219 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  22.54 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  26.27 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  26.87 
 
 
218 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  31.46 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  25.74 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  33.8 
 
 
227 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.82 
 
 
283 aa  44.7  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  25.63 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 
275 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.02 
 
 
626 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.73 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  28.33 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  27.08 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  25.7 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  28.33 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  22.96 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  25.13 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  26.72 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  26.72 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  29.27 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  36.62 
 
 
240 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  30.85 
 
 
282 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  28.36 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 
195 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
247 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  32 
 
 
227 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  41.6  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  26.98 
 
 
216 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  24.41 
 
 
205 aa  41.2  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 
245 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  28.02 
 
 
205 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0300  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
286 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>