More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0454 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0454  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  47.06 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  47.73 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  46.52 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  48.52 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  49.1 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  47.06 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  47.16 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  47.16 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  47.16 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  47.16 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  48.52 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  47.16 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  47.16 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  47.34 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  47.93 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  47.93 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  47.93 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  33.69 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  32.49 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  32.82 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.95 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.22 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 		 194 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  40.25 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.05 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  31.05 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  40.25 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  36.27 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  30.65 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 221 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 231 aa  94.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 220 aa  94.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  33.99 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  34.9 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  34.9 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  29.35 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  34.9 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  38.17 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  34.9 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  34.9 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  34.2 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  32.34 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  34.2 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 204 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.44 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  34.2 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  33.68 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  34.78 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  28.81 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  34.78 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 187 aa  91.7  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  29.47 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  38.17 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  34.24 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  33.68 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  30.59 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  29.75 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.71 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  31.79 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  34.57 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  32.69 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
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