291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0953 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  50.29 
 
 		 695 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  51.21 
 
 		 717 aa  704    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  77.46 
 
 		 712 aa  1154    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  45.8 
 
 		 728 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  47.81 
 
 		 703 aa  680    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 695 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  51.26 
 
 		 723 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 713 aa  1469    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  48.49 
 
 		 722 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  48.79 
 
 		 695 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  50.28 
 
 		 727 aa  712    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  49 
 
 		 721 aa  682    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  84.31 
 
 		 714 aa  1279    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  50.43 
 
 		 711 aa  697    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  77.34 
 
 		 727 aa  1164    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  74.51 
 
 		 714 aa  1123    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  48.11 
 
 		 728 aa  676    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  50.14 
 
 		 726 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  48.01 
 
 		 723 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  49.86 
 
 		 723 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  48.53 
 
 		 695 aa  679    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  46.93 
 
 		 732 aa  693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  46.98 
 
 		 723 aa  668    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  50.78 
 
 		 723 aa  721    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  47.33 
 
 		 729 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  46.51 
 
 		 697 aa  660    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  46.71 
 
 		 730 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  50.57 
 
 		 718 aa  711    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  49.93 
 
 		 726 aa  714    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  50.43 
 
 		 730 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  49.58 
 
 		 721 aa  709    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  46.91 
 
 		 724 aa  663    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  77.45 
 
 		 722 aa  1159    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  51.75 
 
 		 734 aa  733    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  49.16 
 
 		 733 aa  686    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  47.61 
 
 		 696 aa  659    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  49 
 
 		 725 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  47.94 
 
 		 697 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  46.21 
 
 		 706 aa  637    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  48.04 
 
 		 727 aa  662    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  48.86 
 
 		 695 aa  702    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  78.75 
 
 		 714 aa  1173    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  45.76 
 
 		 729 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  51.5 
 
 		 716 aa  718    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  45.66 
 
 		 729 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  49.37 
 
 		 725 aa  698    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  50.07 
 
 		 697 aa  700    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  49.16 
 
 		 726 aa  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  46.03 
 
 		 697 aa  638    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  48.66 
 
 		 699 aa  688    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  50.42 
 
 		 697 aa  703    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  49.79 
 
 		 705 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  51.84 
 
 		 701 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 702 aa  695    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  45.07 
 
 		 724 aa  630  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  44.79 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  44.86 
 
 		 702 aa  611  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  44.96 
 
 		 699 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.62 
 
 		 676 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  37.87 
 
 		 688 aa  492  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.83 
 
 		 688 aa  449  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.44 
 
 		 716 aa  430  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  27.46 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  36.04 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  37.37 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  37.37 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  29.76 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  29.15 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  27.32 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  34.34 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  26.28 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  33.87 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 442 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  26.92 
 
 		 447 aa  57  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  28.11 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1635  glutamine synthetase, type I  39.76 
 
 		 456 aa  56.6  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  24.93 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  37.5 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  32.48 
 
 		 455 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  25.95 
 
 		 461 aa  55.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  28.02 
 
 		 473 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  28.02 
 
 		 473 aa  54.7  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  28.02 
 
 		 473 aa  54.3  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  28.02 
 
 		 473 aa  54.3  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  30.39 
 
 		 473 aa  54.3  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  30.39 
 
 		 473 aa  54.3  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  28.85 
 
 		 455 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  28.48 
 
 		 469 aa  54.3  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  30.36 
 
 		 446 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  27.59 
 
 		 452 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  28.04 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  27.4 
 
 		 470 aa  53.9  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  28.57 
 
 		 454 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  33.07 
 
 		 446 aa  53.9  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 445 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1090  glutamine synthetase, type I  25.88 
 
 		 469 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.603235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  27.91 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  26.97 
 
 		 469 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0109  glutamine synthetase, type I  26.85 
 
 		 469 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  28 
 
 		 439 aa  53.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>