More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0752 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  58.43 
 
 		 702 aa  798    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 676 aa  1388    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  47.65 
 
 		 705 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  46.07 
 
 		 701 aa  631  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  45.57 
 
 		 699 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  44.33 
 
 		 702 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  44.64 
 
 		 695 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  44.78 
 
 		 695 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  45.67 
 
 		 734 aa  616  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  45.29 
 
 		 697 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  45.38 
 
 		 697 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  43.57 
 
 		 695 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  44.71 
 
 		 695 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  46.29 
 
 		 697 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  43.86 
 
 		 717 aa  582  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  43.06 
 
 		 721 aa  579  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  44.54 
 
 		 695 aa  579  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  42.47 
 
 		 718 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  42.32 
 
 		 723 aa  567  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  43.68 
 
 		 716 aa  565  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  42.98 
 
 		 727 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  42.51 
 
 		 733 aa  559  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  41.31 
 
 		 726 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  42.03 
 
 		 712 aa  557  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  41.89 
 
 		 726 aa  558  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  43.29 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  43.15 
 
 		 711 aa  549  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  42.34 
 
 		 721 aa  551  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  41.32 
 
 		 726 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  42.03 
 
 		 714 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  41.18 
 
 		 722 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  41.61 
 
 		 714 aa  545  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  40.66 
 
 		 723 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  41.61 
 
 		 713 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  41.18 
 
 		 727 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  41.48 
 
 		 697 aa  540  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  41.42 
 
 		 703 aa  540  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  40.52 
 
 		 730 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  41.44 
 
 		 706 aa  537  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  42.12 
 
 		 723 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  39.91 
 
 		 722 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  40.06 
 
 		 714 aa  533  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  40.52 
 
 		 697 aa  535  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  40.28 
 
 		 725 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  39.6 
 
 		 724 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  41.02 
 
 		 723 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  41.11 
 
 		 728 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  40.26 
 
 		 723 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  39.48 
 
 		 725 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  40.93 
 
 		 730 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  41.8 
 
 		 729 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  39.31 
 
 		 729 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  40.57 
 
 		 727 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  39.89 
 
 		 732 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  40.34 
 
 		 729 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  40.31 
 
 		 728 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.71 
 
 		 688 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  37.41 
 
 		 724 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  38.35 
 
 		 724 aa  478  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  36.6 
 
 		 699 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.94 
 
 		 716 aa  426  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  35.82 
 
 		 688 aa  426  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  33.09 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  32.84 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  30.38 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  30.53 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  26.79 
 
 		 451 aa  62  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  26.99 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  28.67 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  25.41 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  26.19 
 
 		 451 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  22.73 
 
 		 471 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  24.62 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  23.7 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  32.33 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  28.67 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  28.21 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  26.75 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  28.92 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  26.73 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  25.63 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  26.37 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  24.86 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  26.2 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  36.73 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  27.55 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  26.4 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  25.82 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  25.82 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  27.57 
 
 		 456 aa  57  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  32.12 
 
 		 446 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  29.93 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  26.79 
 
 		 450 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  29.77 
 
 		 443 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  27.96 
 
 		 455 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  29.77 
 
 		 443 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0418  L-glutamine synthetase  30.88 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  27.17 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>