More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0196 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  53.65 
 
 		 703 aa  747    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  56.74 
 
 		 696 aa  811    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  54.43 
 
 		 706 aa  792    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  54.23 
 
 		 716 aa  760    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  53.82 
 
 		 697 aa  773    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  47.29 
 
 		 723 aa  668    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  51.87 
 
 		 730 aa  714    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  53.67 
 
 		 697 aa  789    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  50.57 
 
 		 725 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  52.59 
 
 		 711 aa  728    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  50.99 
 
 		 727 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  50.28 
 
 		 714 aa  695    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  51.71 
 
 		 717 aa  743    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  51.35 
 
 		 726 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  48.71 
 
 		 723 aa  678    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  48.78 
 
 		 723 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  47.04 
 
 		 732 aa  652    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  52.73 
 
 		 721 aa  754    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  48.58 
 
 		 729 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  53.01 
 
 		 723 aa  744    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  52.5 
 
 		 718 aa  763    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  60.69 
 
 		 695 aa  897    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  60.98 
 
 		 695 aa  896    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  49.43 
 
 		 721 aa  700    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  48.92 
 
 		 724 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  59.51 
 
 		 695 aa  890    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 713 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  65.27 
 
 		 699 aa  957    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  55.79 
 
 		 734 aa  805    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  51.07 
 
 		 733 aa  724    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  47.02 
 
 		 728 aa  658    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  58 
 
 		 702 aa  860    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 714 aa  701    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  64.51 
 
 		 695 aa  964    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  47.63 
 
 		 727 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  47.93 
 
 		 730 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  60.95 
 
 		 695 aa  908    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  51.34 
 
 		 714 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  49.57 
 
 		 702 aa  710    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  47.43 
 
 		 722 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  52.29 
 
 		 726 aa  733    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  52.17 
 
 		 712 aa  714    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  51.34 
 
 		 722 aa  706    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  49.35 
 
 		 725 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  52.8 
 
 		 727 aa  749    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  50.86 
 
 		 726 aa  726    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  60.26 
 
 		 697 aa  903    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  49.29 
 
 		 728 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  61.93 
 
 		 697 aa  906    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 697 aa  1445    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  65.17 
 
 		 705 aa  956    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  63.87 
 
 		 701 aa  936    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  47.16 
 
 		 729 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  46.85 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  44.59 
 
 		 724 aa  619  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  44.95 
 
 		 724 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  45.18 
 
 		 729 aa  611  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  45.92 
 
 		 676 aa  598  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  43.73 
 
 		 699 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  42.73 
 
 		 688 aa  555  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  39.32 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  38.78 
 
 		 716 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  32.75 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  41.67 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  31.16 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  31.65 
 
 		 439 aa  63.9  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  28.36 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  30.65 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  29.57 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  30.77 
 
 		 444 aa  62  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  31.03 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  39.77 
 
 		 446 aa  62  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  28.8 
 
 		 447 aa  62  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.74 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  42.67 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  29.03 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  29.28 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  31.39 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  42.11 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  31.78 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  42.11 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  28.05 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  39.53 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  42.11 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 469 aa  60.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  30.05 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  32.39 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  28.88 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  29.57 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  30.8 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  30.05 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  29.84 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  31.28 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1054  glutamine synthetase, type I  28.84 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  31.28 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  29.57 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  29.03 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  30.37 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>