More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1682 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  54.78 
 
 		 717 aa  772    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  82.01 
 
 		 695 aa  1222    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  46.65 
 
 		 732 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  53.8 
 
 		 711 aa  764    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.93 
 
 		 714 aa  715    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  48.99 
 
 		 702 aa  723    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  55.87 
 
 		 726 aa  796    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  65.14 
 
 		 697 aa  980    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  57.7 
 
 		 695 aa  864    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  65.66 
 
 		 699 aa  988    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  53.79 
 
 		 723 aa  784    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  47.28 
 
 		 729 aa  644    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  46.45 
 
 		 729 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  55.81 
 
 		 703 aa  787    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  52.66 
 
 		 706 aa  747    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.14 
 
 		 727 aa  707    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  48.14 
 
 		 714 aa  686    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  54.73 
 
 		 726 aa  804    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  52.37 
 
 		 723 aa  748    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  50.07 
 
 		 723 aa  709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  60.2 
 
 		 697 aa  908    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  45.45 
 
 		 727 aa  637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  49.07 
 
 		 722 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  52.44 
 
 		 730 aa  734    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  46.8 
 
 		 723 aa  658    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  82.3 
 
 		 695 aa  1221    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  57.16 
 
 		 727 aa  810    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  52.35 
 
 		 718 aa  757    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  48.22 
 
 		 728 aa  682    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  53.61 
 
 		 733 aa  771    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  46.99 
 
 		 724 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  53.09 
 
 		 696 aa  751    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47.21 
 
 		 724 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  54.64 
 
 		 734 aa  799    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  53.58 
 
 		 716 aa  765    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  46.79 
 
 		 728 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  65.23 
 
 		 695 aa  985    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 695 aa  1442    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  48.93 
 
 		 714 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 712 aa  706    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  55.38 
 
 		 721 aa  785    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  48.23 
 
 		 722 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  48.86 
 
 		 713 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  47.79 
 
 		 729 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  46.56 
 
 		 724 aa  656    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  51.08 
 
 		 697 aa  728    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  54.65 
 
 		 725 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  53.52 
 
 		 721 aa  772    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  53.72 
 
 		 726 aa  780    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  50.35 
 
 		 730 aa  713    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  51.87 
 
 		 723 aa  740    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  60.95 
 
 		 697 aa  908    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  61.35 
 
 		 702 aa  905    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  64.99 
 
 		 705 aa  972    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  61.58 
 
 		 701 aa  905    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  52.45 
 
 		 697 aa  740    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  55.08 
 
 		 725 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  44.64 
 
 		 676 aa  609  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  44.54 
 
 		 699 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.97 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.76 
 
 		 688 aa  450  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  37.99 
 
 		 716 aa  445  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  27.44 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  26.88 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  39.56 
 
 		 447 aa  67  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  29.11 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  33.94 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  30.53 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  38.14 
 
 		 452 aa  60.1  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  29.83 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  29.83 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  29.07 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  32.74 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1341  glutamine synthetase, type I  27.51 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0145067  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  31.67 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1054  glutamine synthetase, type I  28.17 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  30.09 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  31.5 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0418  L-glutamine synthetase  28.02 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  33.7 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  24.32 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  30.77 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  24.32 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.7 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.7 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  28.08 
 
 		 437 aa  57  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  33.01 
 
 		 470 aa  57  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  26.55 
 
 		 447 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 445 aa  57  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  30.91 
 
 		 470 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.61 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  33.61 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  26.85 
 
 		 456 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  23.58 
 
 		 470 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  32.61 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  34.07 
 
 		 448 aa  55.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  27.48 
 
 		 447 aa  55.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  36.9 
 
 		 476 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>