More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0554 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  75.43 
 
 
705 aa  1133    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  47.79 
 
 
723 aa  653    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  47.88 
 
 
714 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  53.95 
 
 
711 aa  736    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 
730 aa  706    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  55.4 
 
 
697 aa  770    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  58.07 
 
 
695 aa  840    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  48.36 
 
 
729 aa  670    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  53.14 
 
 
723 aa  761    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  54.25 
 
 
726 aa  793    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  47.59 
 
 
732 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  56.08 
 
 
723 aa  806    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  70.77 
 
 
701 aa  1043    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  48.65 
 
 
728 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  65.24 
 
 
702 aa  962    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.01 
 
 
727 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  49.36 
 
 
714 aa  682    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  47.37 
 
 
729 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  53.92 
 
 
697 aa  777    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  55.38 
 
 
726 aa  808    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  53.67 
 
 
702 aa  765    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  51.14 
 
 
722 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  51.57 
 
 
723 aa  733    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  47.94 
 
 
729 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  50.35 
 
 
712 aa  703    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  50.28 
 
 
722 aa  698    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  58.97 
 
 
734 aa  844    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  54.15 
 
 
725 aa  774    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  55.04 
 
 
730 aa  766    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  47.44 
 
 
727 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  49.08 
 
 
728 aa  670    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  54.87 
 
 
716 aa  777    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  52.78 
 
 
718 aa  754    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  55.54 
 
 
727 aa  794    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  48.66 
 
 
713 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  68.53 
 
 
697 aa  1026    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  47.65 
 
 
724 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  48.57 
 
 
724 aa  673    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  52.07 
 
 
723 aa  738    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  68.2 
 
 
695 aa  998    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  53.55 
 
 
703 aa  756    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  55.03 
 
 
706 aa  771    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  71.33 
 
 
697 aa  1062    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  55.43 
 
 
721 aa  797    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  55.01 
 
 
696 aa  780    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  55.11 
 
 
717 aa  775    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 
699 aa  1444    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  52.72 
 
 
721 aa  761    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  65.66 
 
 
695 aa  988    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  49.79 
 
 
714 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  65.27 
 
 
697 aa  957    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  49.5 
 
 
724 aa  694    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  54.66 
 
 
725 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  54.11 
 
 
726 aa  786    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  64.55 
 
 
695 aa  966    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  54.66 
 
 
733 aa  771    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  64.41 
 
 
695 aa  962    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  45.58 
 
 
676 aa  622  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  43.5 
 
 
688 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  43.12 
 
 
699 aa  557  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  39.17 
 
 
688 aa  500  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  40.06 
 
 
716 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  35.57 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  32.24 
 
 
439 aa  73.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  25.93 
 
 
447 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  42.35 
 
 
447 aa  72  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  29.44 
 
 
461 aa  72  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  26.22 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  29.76 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  24.89 
 
 
447 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 
439 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  26.58 
 
 
449 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  28.1 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  36.67 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  28 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  29.63 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  29.11 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  38.04 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  28.57 
 
 
447 aa  67  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  31.76 
 
 
443 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  27.27 
 
 
443 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  28.82 
 
 
444 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
452 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  30.94 
 
 
444 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  34.91 
 
 
454 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  35.51 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  25 
 
 
443 aa  66.6  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  28.42 
 
 
470 aa  66.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  38.04 
 
 
444 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  30.92 
 
 
471 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  27.37 
 
 
443 aa  65.5  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  25.97 
 
 
448 aa  65.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  34.45 
 
 
448 aa  65.1  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  33.96 
 
 
454 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  26.84 
 
 
443 aa  64.7  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  29.41 
 
 
455 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  38.04 
 
 
444 aa  64.7  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  30.34 
 
 
448 aa  64.7  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  38.46 
 
 
444 aa  64.3  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  26.79 
 
 
443 aa  64.3  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>