259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2977 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  46.69 
 
 		 721 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  60.27 
 
 		 728 aa  915    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  48.52 
 
 		 714 aa  682    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  47.23 
 
 		 695 aa  643    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  49.43 
 
 		 695 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  46.25 
 
 		 729 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  48.61 
 
 		 722 aa  690    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  61.63 
 
 		 727 aa  896    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  50.21 
 
 		 702 aa  705    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  47.9 
 
 		 717 aa  682    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  49.08 
 
 		 699 aa  670    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  48.44 
 
 		 703 aa  679    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.01 
 
 		 712 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  47.23 
 
 		 723 aa  668    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  46.47 
 
 		 697 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  61.72 
 
 		 729 aa  916    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.01 
 
 		 727 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  49.15 
 
 		 714 aa  688    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  47.66 
 
 		 726 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 728 aa  1500    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  47.77 
 
 		 723 aa  668    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  46.92 
 
 		 723 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  49 
 
 		 695 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  47.02 
 
 		 733 aa  652    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  48.22 
 
 		 697 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  48.46 
 
 		 718 aa  698    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  59.12 
 
 		 723 aa  883    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  46.81 
 
 		 727 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  45.78 
 
 		 722 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  63.47 
 
 		 724 aa  949    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  64.67 
 
 		 732 aa  993    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  46.14 
 
 		 726 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 716 aa  697    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  47.34 
 
 		 730 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  48.22 
 
 		 695 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  49.01 
 
 		 714 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  48.02 
 
 		 723 aa  665    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  45.49 
 
 		 724 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  59.21 
 
 		 729 aa  911    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  46.7 
 
 		 725 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  50.07 
 
 		 695 aa  699    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  49.29 
 
 		 697 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  47.94 
 
 		 705 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  48.71 
 
 		 701 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  49.07 
 
 		 711 aa  674    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  50.69 
 
 		 734 aa  722    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  51.06 
 
 		 721 aa  712    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  46.44 
 
 		 725 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  48.11 
 
 		 713 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  45.89 
 
 		 726 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46.59 
 
 		 702 aa  624  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  44.03 
 
 		 730 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  44.92 
 
 		 706 aa  612  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  44.78 
 
 		 724 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  44.62 
 
 		 697 aa  605  9.999999999999999e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  44.52 
 
 		 697 aa  605  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  44.59 
 
 		 696 aa  601  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.17 
 
 		 699 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40.08 
 
 		 676 aa  496  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39 
 
 		 688 aa  496  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.36 
 
 		 688 aa  434  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.27 
 
 		 716 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  30.83 
 
 		 439 aa  62  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  32.91 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  32.64 
 
 		 447 aa  60.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  27.06 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  31.16 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  27.34 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  39.29 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  31.03 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  31.21 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  28.84 
 
 		 430 aa  57  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  24.58 
 
 		 449 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  34.74 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  30.94 
 
 		 431 aa  55.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  26.15 
 
 		 476 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  28.97 
 
 		 439 aa  54.7  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  36.25 
 
 		 447 aa  54.3  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  29.75 
 
 		 446 aa  54.3  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  32.26 
 
 		 448 aa  54.3  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.83 
 
 		 444 aa  54.3  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  26.95 
 
 		 458 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  27.8 
 
 		 470 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  30.41 
 
 		 444 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  36.47 
 
 		 446 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  27.27 
 
 		 450 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  30.57 
 
 		 455 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  24.68 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  30.3 
 
 		 443 aa  53.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  24.68 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  32.17 
 
 		 466 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  29.77 
 
 		 446 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  29.05 
 
 		 439 aa  52  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  27.32 
 
 		 470 aa  52  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  27.32 
 
 		 470 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  29.32 
 
 		 445 aa  51.6  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  27.1 
 
 		 453 aa  51.6  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 444 aa  51.2  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  35.9 
 
 		 448 aa  51.2  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  28.85 
 
 		 469 aa  50.8  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>