More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2494 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  74.89 
 
 		 474 aa  751    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 476 aa  987    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  65.4 
 
 		 475 aa  680    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  71.46 
 
 		 473 aa  739    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  91.81 
 
 		 476 aa  914    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  36.9 
 
 		 445 aa  230  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.73 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.17 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.17 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.33 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  35.21 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  35.27 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  34.61 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  35.57 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  34.33 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.02 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  34.49 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  34.75 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 444 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 444 aa  220  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 444 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  34.59 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  34.55 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  34.77 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  34.1 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  34.55 
 
 		 444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  34.87 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.02 
 
 		 447 aa  217  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  36.67 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  33.25 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  34.4 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.77 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  34.45 
 
 		 439 aa  213  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  33.56 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.13 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  32.54 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  33.1 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  33.73 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  32.32 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  34.61 
 
 		 439 aa  210  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  33.97 
 
 		 447 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  34.86 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  33.57 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  31.96 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  35.31 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  35.04 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  32.36 
 
 		 453 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  32.18 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 439 aa  203  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  32.27 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  32.36 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  32.84 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  31.85 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  32.13 
 
 		 440 aa  200  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  31.94 
 
 		 443 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  33.26 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  32.05 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  33.18 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  32.79 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  32.3 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  30.02 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  32.09 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  32.49 
 
 		 444 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  31.82 
 
 		 444 aa  197  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 		 442 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  35.14 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  31.76 
 
 		 448 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  35.08 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  33.25 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  33.42 
 
 		 442 aa  192  8e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  31.72 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  32.68 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.48 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  34.06 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  33.07 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  32.06 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  31.86 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  31.08 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  32.63 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  32.94 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  32.11 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  31.58 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  31.62 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  30.69 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  31.88 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  31.21 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  31.76 
 
 		 448 aa  186  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  33.01 
 
 		 433 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  36.34 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  31.37 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>